——宋元时期中外交流规模扩大，中医药学术体系有了突破性进展
　　宋元时期，对外贸易发达，海陆交通均超过唐代，医药交流也较前扩大。
　　指南针的应用，航海业的发达，扩大了交流规模，丰富了中医药学理论。在宋至元的400年间，中国与60多个国家和地区有通商和贸易往来。随着海外贸易的发展，大量香料药的输入丰富了中医治法。
　　宋金元时期中国与东南亚诸国海上贸易十分发达，据《宋会要辑稿》、《云麓漫钞》、《诸蕃志》、《真腊风土记》等书记载，在福建泉州进出的大批货物中，仅进口的药物品种就达300余种，如乳香、木香、沉香、檀香、茴香、丁香、安息香、金颜香、苏合香油、降真香、龙涎香等。中越往来频繁，宋代中国医生申光逊曾以胡椒、干姜等辛辣药物治愈过越南人的脑痛症。据《大越史记》记载，元代针灸医生邹庚曾到越南为诸侯王治病。此外，越南治痢疾药方也于此时传入中国。
　　活字印刷为医书大量刊行提供了条件。宋校正医书局的设立，促进了医学著述和传播，此间出版了许多大型方书和本草书，如《太平惠民和剂局方》、《太平圣惠方》、《圣济总录》、《开宝本草》、《证类本草》、《正和本草》、《绍兴本草》等，这些医书的刊行有力促进了地域间及中外医药的广泛交流。宋代于大中祥符九年（1016年）、天禧五年（1021年）两次赠送《太平圣惠方》给朝鲜。宋徽宗建中靖国元年（1101年），赵佶赠送高丽使者《太平圣惠方》100卷、《神医普救方》100卷和《太平御览》10000卷。不久，《图经本草》和《和剂局方》也传入朝鲜。朝鲜不仅收藏从中国传入的医书，而且翻刻刊行，使中医学在该国更广泛地传播。宋元祐六年（1091年）哲宗向高丽王请求献出所藏的中国善本医书，高丽宣宗于元祐八年（1093年），遣黄宗悫来中国呈送《黄帝针经》8卷（国内亡佚），宋朝当时以此为底本重新颁行。宋代刊行医籍很多，日本人来华带回大量医书。宋初，日本出现了整理编写中医书籍的医学著作，如984年，日本丹波康赖参考宋以前方书200余部，编成《医心方》，不但传播了中医知识，而且保存了许多散佚方书。
　　中朝两国使节和医生往来频繁。元世祖至元六年间忽必烈先后4次（1275、1279、1282、1293年）应高丽帝王之邀派遣医师、太医赴高丽，为王室治病。朝鲜也派医生来华行医，至元二十三年（1286年）3月，元世祖有病求高丽派良医，高丽先后派尚药侍医薛景成为其治病，对其医术忽必烈多予赏赐。两国医生的来往直接促进了中朝医学的发展。同时，朝鲜不少药物在唐以后陆续输入中国，其中如人参、白附子尤其有名。
　　宋代于971年在广州设市舶司，管理对外贸易。据《宋会要》记载，经过市舶司，由阿拉伯商人运往欧洲的药物有60多种，如朱砂、人参、牛黄、茯苓、附子、水银、川椒等，其中尤以牛黄极受重视，往往放在金银制的盒中收藏，以供辟疫之用。元代，中国药物、针灸疗法也传入阿拉伯及附近国家。如《马可波罗行记》记载中国药材外运的情况说，在马拉巴看到的大量中国船只中，带有马拉巴所没有的许多药材，并说这些药材连同其它货物，被商人运往亚丁，由亚丁再运到亚历山大里亚等地。书中还具体介绍了中国的姜、茶、胡椒、大黄、麝香、肉桂等药材。与此同时，一些阿拉伯药用治法也在中国流传开来，如苏合香油、舍利别（即糖浆剂）、阿刺吉酒等。参照阿拉伯传入的金银丸衣法，《和剂局方》开始采用金银箔包裹丸剂，并发展为多种丸。
　　元代于1270年设立“广惠司”，是一种阿拉伯式的医院组织，有阿拉伯医生担任医疗。1292年又在京城设立“回回药物院”。当时还翻译了阿拉伯的医药书籍，如《回回药方》等，在一定程度上丰富了中国医学。
　　约在1313年，波斯医生拉什德·阿尔丁·阿尔哈姆丹尼（Rashid al-Din al-Hamdani约1247—1318）编纂了波斯文的中国医药百科全书，名为《伊尔汗的中国科学宝藏》，包括有脉学、解剖学、胚胎学、妇产科学、药物学等，其中特别提到了王叔和的名字。这部书中附有内脏解剖图以及切脉部位图。
　　13世纪中叶，欧洲人爱薛和约翰等都曾在京师行医，并把西医介绍到中国。阿拉伯人在华寄居传来习用治法和药物，当时北京就有中国和阿拉伯医学两种不同的医学体系。中医药学吸收了民族的和外来医药文化知识，极大地丰富了中医药学的宝库。